Не мешало бы посмотреть как играешь, именно левую руку. Хорошо бы видео заснять с игрой тех самых сложных аккордов.
Если не получится с видео, то давай попробуем по-другому.
1) разминаешься ли перед игрой. если да, то какие там у тебя “скорости”.
2) может ты не часто занимаешься и требуется время, чтобы руки снова набрали форму
если такие боли постоянно, то возникает вопрос – а так ли нужные эти аккорды в районе 3-его лада?
может можно обойтись без них.
Если без них никак, то начни брать эти аппликатуры лада с 10-го. Раз в два дня перемещаясь к голове грифа на один лад.
PS: тема боли в руках при игре вообще очень сложная. Тут без просмотра самого процесса игры сложно понять что происходит. Может быть просто короткие пальцы и барре на 3-ем ладу противопоказано? Тогда стоит перейти на гитары с уменьшенной мензурой.